Bidikmisi merupakan salah satu beasiswa terbesar yang ada di UIN Jakarta. Saat ini, ada 770 mahasiswa yang aktif terdaftar sebagai penerima Bidikmisi terhitung dari tahun 2011 hingga 2014. Namun, ternyata masih banyak kekurangan dan ketidakpuasan mahasiswa terhadap beasiswa tersebut. Divisi Litbang INSTITUT melakukan survei kepada 95 orang penerima Bidikmisi tahun 2013 dan 2014.Berdasarkan hasil survei, 54% responden merasa uang Bidikmisi masih kurang untuk memenuhi kebutuhannya, sedangkan 46% lainnya menyatakan cukup. Survei ini juga menunjukkan, 92% responden menyatakan uang Bidikmisi tidak pernah turun tepat waktu, hanya 8% yang menjawab turun tepat waktu.
Tak hanya itu, 30% responden juga menyatakan uang Bidikmisi yang ia terima pernah mengalami pemotongan. Sedangkan 70% lainnya mengaku tidak pernah mengalami pemotongan uang Bidikmisi. Dalam hal ini, responden menyatakan jumlah pemotongan uang Bidikmisi beragam mulai dari Rp150 ribu hingga Rp1,5 juta.Hasil survei pula menunjukan, 72% responden merasa pihak kampus belum transparan terkait informasi Bidikmisi. Hanya 28% yang menyatakan pihak kampus sudah transparan. Sementara itu, 70% responden belum puas dengan pelayanan kampus terkait Bidikmisi, sedangkan 30% lainnya mengaku sudah puas.
